山南市琼结县地处雅鲁藏布江中游南岸雅砻河（即雅拉香波曲）西支流琼波曲（俗称琼结河）流域，是冈底斯山脉和喜马拉雅山脉之间藏南河谷平原的一部分，大约在北纬28°8′～29°12′、东经90°41′～91°52′之间，东面和北面与乃东县毗连，南面和西面与措美县为邻，西北与扎囊县相接,全县国土面积0.103万平方公里。全县东、南、西三面环山，地势西南高东北低，县城所在地琼结雪（琼结镇所在地雪巴社区），距离山南市政府驻地泽当28公里，海拔3740米。
全县辖1个镇、3个乡:琼结镇、拉玉乡、下水乡、加麻乡。共有5个社区、15个行政村，71个自然村。县人民政府驻琼结镇琼结雪巴社区。
琼结镇:辖5个社区:雪康、仲堆、白日、雪巴、东嘎。
拉玉乡:辖5个村委会:日玛岗村、德庆村、强吉村、堆巴村、白那村。
下水乡:辖4个村委会:下水村、措杰村、唐布齐村、久河村。
加麻乡:辖6个村委会:加麻村、特日村、扎西村、金珠村、白松村、昌嘎村。
